Depuis la création de la délégation Rhône-Alpes de la Fondation du Patrimoine en 2000, les deux structures ont travaillé le plus possible en partenariat sur les dossiers qui le permettaient. En 2007, ce partenariat se traduit d’un manière écrite. En 2009, c’est avec la délégation de la Fondation du Patrimoine et la Fondation Renaud que Patrimoine Aurhalpin crée la commission Musées locaux et lieux de collection.
En 2014, le déménagement de Patrimoine Aurhalpin dans les locaux du Fort de Vaise rapproche encore les deux structures puisque leurs bureaux y sont voisins.
Patrimoine Aurhalpin et la Fondation du Patrimoine ont concrétisé leur partenariat, dans le but de concourir ensemble à la valorisation du patrimoine régional dans les douze départements d’Auvergne-Rhône-Alpes. Ce partenariat assure une collaboration systématique sur des thèmes communs aux deux partenaires.
